CGM欧洲区新一期（CGM-EU35，总270期），我们非常荣幸地邀请到了哈佛医学院和波士顿儿童医院的陶建立博士，将为大家带来题为“逆转座子LINE-1与潜在的CRISPR基因编辑风险”的演讲。LINE-1是现今人体内存在的唯一具有自主转座活性的逆转座子，占人类基因组总量的17%。尽管在正常分化的细胞中LINE-1一般都保持沉默状态，但在生殖和胚胎细胞发育、特定神经细胞以及肿瘤细胞中则为激活状态。本期，我们欢迎陶建立博士为大家讲解他们关于逆转座子LINE-1如何参与到CRISPR/Cas9编辑过程中的精彩工作！
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欧中时间：
2022 年 7 月 30 号（星期六）08 PM（CET）
其他时区：
美中时间 2022 年 7 月 30 号（星期六）01 PM
美东时间 2022 年 7 月 30 号（星期六）02 PM
北京时间 2022 年 7 月 31 号（星期日）02 AM
03
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第270期：逆转座子LINE-1与潜在的CRISPR基因编辑风险
版主： Tlexander
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Tlexander楼主
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- 注册时间： 2022年 7月 22日 17:34
Re: 第270期：逆转座子LINE-1与潜在的CRISPR基因编辑风险
1, 对于不完整的line1 就不起作用吗
2, 常规的RNA-seq是不是把LINE-1的transcript都fitter out了？
3, 能否简单地科普一下GUIDE-seq和HTGTs的原理？
4, polyaseq 是否只能检测line1 insertion呢
5, 新插入的LINE-1的DNA methylation status如何？？
6, 有个想法: 能否直接利用nanopore 靶向测myc区域，来更广泛地检测crispr导致的变异呢
7, 目前base edit的off-target的潜在原因是否有一些总结？
8, 能否科普一下一下步Gene Editing主要的发展方向？
9, 杨辉教授base edit的结果还有一些左侧散落有富集趋势的插入，这是否可能是由于cohesion导致的，这两处富集位点的Hi-C数据有验证吗？
10，dose-dependency是否有做？采用的是外源LINE-1，是否有对内源LINE-1进行评估。外源确实有好处，因为LINE-1占17%human genome.
2, 常规的RNA-seq是不是把LINE-1的transcript都fitter out了？
3, 能否简单地科普一下GUIDE-seq和HTGTs的原理？
4, polyaseq 是否只能检测line1 insertion呢
5, 新插入的LINE-1的DNA methylation status如何？？
6, 有个想法: 能否直接利用nanopore 靶向测myc区域，来更广泛地检测crispr导致的变异呢
7, 目前base edit的off-target的潜在原因是否有一些总结？
8, 能否科普一下一下步Gene Editing主要的发展方向？
9, 杨辉教授base edit的结果还有一些左侧散落有富集趋势的插入，这是否可能是由于cohesion导致的，这两处富集位点的Hi-C数据有验证吗？
10，dose-dependency是否有做？采用的是外源LINE-1，是否有对内源LINE-1进行评估。外源确实有好处，因为LINE-1占17%human genome.