生命数字化时代来临:全基因组计算成本不到1美元
发表于 : 2022年 8月 28日 17:11
为此,Oracle甲骨文云发布了相应的评测文章,该测试项目使用了OCI提供的最新的 ARM 和 x86计算实例,利用OCI硬件资源分配与优化机制,搭配Sentieon软件进行了一系列的运算耗时和云成本估算的基准测试。旨在为用户实现全基因组二级分析的高效计算和低成本的最佳平衡。
在分析流程上,该项目选择了Sentieon DNAseq(v202112.01)流程作为软件方案。Sentieon DNAseq 作为行业金标准 BWA-GATK 的直接替代品,不仅能提供与 BWA-GATK 流程一致的分析结果,而且灵活性强,运行速度更比GATK 快 5-20 倍。
在分析流程上,该项目选择了Sentieon DNAseq(v202112.01)流程作为软件方案。Sentieon DNAseq 作为行业金标准 BWA-GATK 的直接替代品,不仅能提供与 BWA-GATK 流程一致的分析结果,而且灵活性强,运行速度更比GATK 快 5-20 倍。