许锦波有哪篇文章被引超过千次吗?
版主: Softfist
#2 Re: 许锦波有哪篇文章被引超过千次吗?
Accurate De Novo Prediction of Protein Contact Map by Ultra-Deep Learning Model
S Wang, S Sun, Z Li, R Zhang, J Xu
PLOS Computational Biology 13 (1), e1005324
Google scholar citation: 1022
S Wang, S Sun, Z Li, R Zhang, J Xu
PLOS Computational Biology 13 (1), e1005324
Google scholar citation: 1022
#3 Re: 许锦波有哪篇文章被引超过千次吗?
Template-based protein structure modeling using the RaptorX web server
M Källberg, H Wang, S Wang, J Peng, Z Wang, H Lu, J Xu
Nature protocols 7 (8), 1511-1522
Google scholar citation: 1925
M Källberg, H Wang, S Wang, J Peng, Z Wang, H Lu, J Xu
Nature protocols 7 (8), 1511-1522
Google scholar citation: 1925
#4 Re: 许锦波有哪篇文章被引超过千次吗?
两位诺奖得主的这篇2021年的Nature被引27000+
Highly accurate protein structure prediction with AlphaFold
J Jumper, R Evans, A Pritzel, T Green, M Figurnov, O Ronneberger, ...
nature 596 (7873), 583-589
Highly accurate protein structure prediction with AlphaFold
J Jumper, R Evans, A Pritzel, T Green, M Figurnov, O Ronneberger, ...
nature 596 (7873), 583-589
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#5 Re: 许锦波有哪篇文章被引超过千次吗?
这倒是未必,诺奖奖励原创性,庄小威比那个得诺奖得做的要好,但是也没有奖。none 写了: 2024年 10月 14日 03:40 两位诺奖得主的这篇2021年的Nature被引27000+
Highly accurate protein structure prediction with AlphaFold
J Jumper, R Evans, A Pritzel, T Green, M Figurnov, O Ronneberger, ...
nature 596 (7873), 583-589
不过对于Alphafold,我估计domain logic并不是最重要得创新,可能只有30%,70%其实是DL架构方面得构建。
深度学习方面徐金波比Deepmind差得远。
#7 Re: 许锦波有哪篇文章被引超过千次吗?
J Jumper, R Evans, A Pritzel, T Green, M Figurnov, O Ronneberger, ...
Nature 596 (7873), 583-589
这文章是一个大团队,35个人一起干的,而且DeepMind背后是Google, 财大气粗,Google大力宣传,引用量肯定高啊!
诺奖评选似乎有很大问题,对原创的贡献似乎视而不见。同样AI领域,LSTM提出者Jürgen站出来反对Hinton得诺奖,Nature也炮轰提名过程不透明 (https://m.huxiu.com/article/3560492.html)。
Nature 596 (7873), 583-589
这文章是一个大团队,35个人一起干的,而且DeepMind背后是Google, 财大气粗,Google大力宣传,引用量肯定高啊!
诺奖评选似乎有很大问题,对原创的贡献似乎视而不见。同样AI领域,LSTM提出者Jürgen站出来反对Hinton得诺奖,Nature也炮轰提名过程不透明 (https://m.huxiu.com/article/3560492.html)。
#9 Re: 许锦波有哪篇文章被引超过千次吗?
如果他真的那么早就解决了蛋白预测问题 引用轻松上十万
那么多千老怎么会傻傻等四年 作者不白就不用
alphafold2之前 都是用uiuc的zhang yang的i-tasser
https://zhanggroup.org/I-TASSER/
这个zhangyang 就是约炮偷拍那个 教授
那么多千老怎么会傻傻等四年 作者不白就不用
alphafold2之前 都是用uiuc的zhang yang的i-tasser
https://zhanggroup.org/I-TASSER/
这个zhangyang 就是约炮偷拍那个 教授
#11 Re: 许锦波有哪篇文章被引超过千次吗?
一看你就是资深千老,来,千老和千老握握手

huangchong 写了: 2024年 10月 14日 08:22 如果他真的那么早就解决了蛋白预测问题 引用轻松上十万
那么多千老怎么会傻傻等四年 作者不白就不用
alphafold2之前 都是用uiuc的zhang yang的i-tasser
https://zhanggroup.org/I-TASSER/
这个zhangyang 就是约炮偷拍那个 教授
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#12 Re: 许锦波有哪篇文章被引超过千次吗?
你错了,citation根本就不客观
比如我老板弄了一个领域,但他那篇领域最早的文章,还如不后来别人的几篇综述引用更高
再如国内搞纳米的王忠林,虽然做的东西国外都鄙视,但架不住国内徒子徒孙众多,随便灌一篇水文,引用也能轻松上万
比如我老板弄了一个领域,但他那篇领域最早的文章,还如不后来别人的几篇综述引用更高
再如国内搞纳米的王忠林,虽然做的东西国外都鄙视,但架不住国内徒子徒孙众多,随便灌一篇水文,引用也能轻松上万
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#13 Re: 许锦波有哪篇文章被引超过千次吗?
这个问题确实也存在 很多时候会出现曲高和寡的情况dfc8622 写了: 2024年 10月 14日 10:58 你错了,citation根本就不客观
比如我老板弄了一个领域,但他那篇领域最早的文章,还如不后来别人的几篇综述引用更高
再如国内搞纳米的王忠林,虽然做的东西国外都鄙视,但架不住国内徒子徒孙众多,随便灌一篇水文,引用也能轻松上万
alphafold被引两万多次 其实很多是因为用户跑了他的预测 又因为这个工具感觉很热门很高大上 觉得引了以后给自己paper增光 所以加个引用 并不是引他的方法 所以这个引用数 一方面说明它确实满足很多人的需要 另一方面也不能太当回事
以前sheldrick的shelX 因为解化学结构和生物分子结构都用 以一己之力把晶体学会刊(acta crst)中的一本影响因子提了十几还是二十几

至于 出了个工具没人引用这个情况 也得具体分析 也许是工具没宣传好 或者确实不好用 (其实确实经常是工具本身不行)
还有些情况是工具其实很好 但是用户很傻 觉得用这玩意是天经地义 没什么了不起 不觉得这工具需要加引用
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#14 Re: 许锦波有哪篇文章被引超过千次吗?
主要这个原创的想法太普通,并不是别人想不到的,而且也没有给出最后大家能用的实现。
当然大家争议也在这里:究竟是第一个吃螃蟹的人重要还是第一个提出让别人也能一起吃螃蟹的重要
当然大家争议也在这里:究竟是第一个吃螃蟹的人重要还是第一个提出让别人也能一起吃螃蟹的重要
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#15 Re: 许锦波有哪篇文章被引超过千次吗?
张峰,庄晓微的case,他们又会说是原创最重要huangchong 写了: 2024年 10月 14日 11:10 这个问题确实也存在 很多时候会出现曲高和寡的情况
alphafold被引两万多次 其实很多是因为用户跑了他的预测 又因为这个工具感觉很热门很高大上 觉得引了以后给自己paper增光 所以加个引用 并不是引他的方法 所以这个引用数 一方面说明它确实满足很多人的需要 另一方面也不能太当回事
以前sheldrick的shelX 因为解化学结构和生物分子结构都用 以一己之力把晶体学会刊(acta crst)中的一本影响因子提了十几还是二十几当然sheldrick是牛逼人物 应该的
至于 出了个工具没人引用这个情况 也得具体分析 也许是工具没宣传好 或者确实不好用 (其实确实经常是工具本身不行)
还有些情况是工具其实很好 但是用户很傻 觉得用这玩意是天经地义 没什么了不起 不觉得这工具需要加引用
#16 Re: 许锦波有哪篇文章被引超过千次吗?
https://scholar.google.com/citations?us ... AAAJ&hl=en
-- 去Jumper的GS,可以发现他最早的两篇文章一个发在science(2010),一个发在CELL(2012),也就是25岁和27岁的时候的文章。他2017年才博士毕业,我不知道这么年青能在science/CELL上发文章,是怎么做到的。
-- 留意这两篇文章,一篇的第一作者,另外一篇的最后一个作者,都是D。E。 Shaw。 这个人是搞对冲基金的大富豪。但是本世纪以来一直专心搞计算生物学。
-- 从上面这个背景看,Jumper是一直搞计算生物学,而且颇有成就。因此不太可能是迟至2016年听了许锦波的报告以后,才会萌生用DL来结构蛋白质的想法。
-- Xu的报告,Jumper会去,这个很正常,本来就是同行。听报告集思广益,是工作的本份。
我猜今年的化学奖,Shaw应该是个感到失落的人。起了个大早,有钱有脑,最后两手空空,让Hassabis截胡了。
-- 去Jumper的GS,可以发现他最早的两篇文章一个发在science(2010),一个发在CELL(2012),也就是25岁和27岁的时候的文章。他2017年才博士毕业,我不知道这么年青能在science/CELL上发文章,是怎么做到的。
-- 留意这两篇文章,一篇的第一作者,另外一篇的最后一个作者,都是D。E。 Shaw。 这个人是搞对冲基金的大富豪。但是本世纪以来一直专心搞计算生物学。
-- 从上面这个背景看,Jumper是一直搞计算生物学,而且颇有成就。因此不太可能是迟至2016年听了许锦波的报告以后,才会萌生用DL来结构蛋白质的想法。
-- Xu的报告,Jumper会去,这个很正常,本来就是同行。听报告集思广益,是工作的本份。
我猜今年的化学奖,Shaw应该是个感到失落的人。起了个大早,有钱有脑,最后两手空空,让Hassabis截胡了。
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#17 Re: 许锦波有哪篇文章被引超过千次吗?
Xu的模型已经证明了DL的可行性并给jumper提供了参照物
绝对算pioneer的贡献
绝对算pioneer的贡献
TestCases 写了: 2024年 10月 14日 12:06 https://scholar.google.com/citations?us ... AAAJ&hl=en
-- 去Jumper的GS,可以发现他最早的两篇文章一个发在science(2010),一个发在CELL(2012),也就是25岁和27岁的时候的文章。他2017年才博士毕业,我不知道这么年青能在science/CELL上发文章,是怎么做到的。
-- 留意这两篇文章,一篇的第一作者,另外一篇的最后一个作者,都是D。E。 Shaw。 这个人是搞对冲基金的大富豪。但是本世纪以来一直专心搞计算生物学。
-- 从上面这个背景看,Jumper是一直搞计算生物学,而且颇有成就。因此不太可能是迟至2016年听了许锦波的报告以后,才会萌生用DL来结构蛋白质的想法。
-- Xu的报告,Jumper会去,这个很正常,本来就是同行。听报告集思广益,是工作的本份。
我猜今年的化学奖,Shaw应该是个感到失落的人。起了个大早,有钱有脑,最后两手空空,让Hassabis截胡了。
#18 Re: 许锦波有哪篇文章被引超过千次吗?
dl的可行性2012年已经验证了,今年也发出来诺贝尔物理奖。
2016年的时候是搞计算生物学的人大多数都准备搞一下DL,都知道DL有可行性。Jumper看Xu怎么搞的,Xu也看Jumper怎么搞的。我猜这个应该是当时的实际情况。能难把这个可行性的Credit归给Xu。当然Xu要是个白人的话,发一个给他,也不是什么大不了的事。
这里面最失落的应该是Shaw,本来是带着Jumper混的,怎么放手让他跟了Hassabis了。
#19 Re: 许锦波有哪篇文章被引超过千次吗?
从现在起,习主席应该派人带钱常驻斯德哥尔摩。附近那几十家餐馆买下来专门搞活动。给老杨再搞个物理学奖。
这玩意等是等不来了。
北京老头喜得诺贝尔,FOR THE 2ND TIME, AT 103, 这个是给北京另外一个老头习近平脸上贴金,这么明显的事。
这玩意等是等不来了。
北京老头喜得诺贝尔,FOR THE 2ND TIME, AT 103, 这个是给北京另外一个老头习近平脸上贴金,这么明显的事。
#20 Re: 许锦波有哪篇文章被引超过千次吗?
老杨要是2025拿诺贝尔奖的话,其爆炸性有4:TestCases 写了: 2024年 10月 14日 12:44 从现在起,习主席应该派人带钱常驻斯德哥尔摩。附近那几十家餐馆买下来专门搞活动。给老杨再搞个物理学奖。
这玩意等是等不来了。
北京老头喜得诺贝尔,FOR THE 2ND TIME, AT 103, 这个是给北京另外一个老头习近平脸上贴金,这么明显的事。
1)103岁了。
2)拿过一次了。
3)翁帆(全世界人民喜闻乐见)
4)物理学已死:要么发给AI,要么发给103.
等颁奖的时候,老杨以百岁高龄为由,以视频的方式录了份获奖感言。翁帆代领。习主席把自己专机借给翁帆飞到瑞典领奖,回程由丁薛祥接机。飞机油耗等一切费用从习主席稿费里支付。