正式回应了。
https://m.163.com/dy/article/J1OKOKDH05 ... ss=adap_pc
能教授确实很害怕alphafold 开始研究暗物质？
版主： Softfist
#2 Re: 能教授确实很害怕alphafold 开始研究暗物质？
alphafold 是换道超车， 冷冻电镜基本没有活路了.
能够苟延的方向， 注重分子的超级结构， 聚合体, 亚细胞器...或 精子穿透卵子膜的结构基础！
：）
这是咱老板当时与nih一帮人合作搞出来的.
图中蓝的是五聚体， 其余黄的是六聚体.
这五聚体和六聚体， 都是同一分子！ 这就提出了一个命题： 分子的最终结构不是唯一的！
咱给老板拿到了实验证据， 五聚体和六聚体的存在，它们的稳定性由微环境决定！
能够苟延的方向， 注重分子的超级结构， 聚合体, 亚细胞器...或 精子穿透卵子膜的结构基础！
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这是咱老板当时与nih一帮人合作搞出来的.
图中蓝的是五聚体， 其余黄的是六聚体.
这五聚体和六聚体， 都是同一分子！ 这就提出了一个命题： 分子的最终结构不是唯一的！
咱给老板拿到了实验证据， 五聚体和六聚体的存在，它们的稳定性由微环境决定！
上次由 weiqu 在 2024年 5月 9日 17:56 修改。
#3 Re: 能教授确实很害怕alphafold 开始研究暗物质？
她应该是最能具体说清楚ALPHAFOLD对她这个行当的哪部分工作带来了颠覆性的冲击的。为什么冲击最大？以后怎么办？
但是这些她都不说，却说什么对alphafold “敬畏”，莫名其妙。
但是这些她都不说，却说什么对alphafold “敬畏”，莫名其妙。
#4 Re: 能教授确实很害怕alphafold 开始研究暗物质？
现在是院士了么?weiqu 写了： 2024年 5月 9日 17:23 alphafold 是换道超车， 冷冻电镜基本没有活路了.
能够苟延的方向， 注重分子的超级结构， 聚合体, 亚细胞器...
：）
这是咱老板当时与nih一帮人合作搞出来的.
图中蓝的是五聚体， 其余黄的是六聚体.
这五聚体和六聚体， 都是同一分子！ 这就提出了一个命题： 分子的最终结构不是唯一的！
咱给老板拿到了实验证据， 五聚体和六聚体的存在，它们的稳定性由微环境决定！
#6 Re: 能教授确实很害怕alphafold 开始研究暗物质？
能不能问问X-聚体啥意思？weiqu 写了： 2024年 5月 9日 17:23 alphafold 是换道超车， 冷冻电镜基本没有活路了.
能够苟延的方向， 注重分子的超级结构， 聚合体, 亚细胞器...或 精子穿透卵子膜的结构基础！
这是咱老板当时与nih一帮人合作搞出来的.
图中蓝的是五聚体， 其余黄的是六聚体.
这五聚体和六聚体， 都是同一分子！ 这就提出了一个命题： 分子的最终结构不是唯一的！
咱给老板拿到了实验证据， 五聚体和六聚体的存在，它们的稳定性由微环境决定！
#7 Re: 能教授确实很害怕alphafold 开始研究暗物质？
就是单分子形成的聚合体， 是病毒装配过程中的中间体！
注意， alpgafold是没有本事predict 的！
咱提到精子穿过卵子后， 卵子的膜结构起了变化， 上亿精子， 吾仅取一枚！
：）
#9 Re: 能教授确实很害怕alphafold 开始研究暗物质？
内行， 好像是t吧？
咱曾做过一个自认很牛的实验，因为咱拿到了条件， 高盐环境， 仅有六聚体， 高疏水环境， 仅有五聚体， 所以咱可以输入五聚体和六聚体的比， 看对装配的成功率！ 惊人的是， 就是病毒它那个T no. 时， 成功率最大！
等等， 咱先去给老天爷烧柱香！ 膜拜之！
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#10 Re: 能教授确实很害怕alphafold 开始研究暗物质？
5聚体就是五个分子聚在一起。6聚体就是六个分子聚在一起。这些分子不管咋个聚法，本身都是一样一样的，是么？weiqu 写了： 2024年 5月 9日 18:08 就是单分子形成的聚合体， 是病毒装配过程中的中间体！
注意， alpgafold是没有本事predict 的！
咱提到精子穿过卵子后， 卵子的膜结构起了变化， 上亿精子， 吾仅取一枚！
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#13 Re: 能教授确实很害怕alphafold 开始研究暗物质？
这样理解吧， 分子本身的结构是由一级结构（顺序）决定的， 是块砖， 但同样的砖可以盖不同的房子（四级结构）.
做蛋白工作的， 有个概念， 蛋白的刚性和柔性， 蛋白变性就是环境过了刚性的临界点！
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上次由 weiqu 在 2024年 5月 9日 20:04 修改。
#14 Re: 能教授确实很害怕alphafold 开始研究暗物质？
weiqu 写了： 2024年 5月 9日 17:23 alphafold 是换道超车， 冷冻电镜基本没有活路了.
能够苟延的方向， 注重分子的超级结构， 聚合体, 亚细胞器...或 精子穿透卵子膜的结构基础！
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这是咱老板当时与nih一帮人合作搞出来的.
图中蓝的是五聚体， 其余黄的是六聚体.
这五聚体和六聚体， 都是同一分子！ 这就提出了一个命题： 分子的最终结构不是唯一的！
咱给老板拿到了实验证据， 五聚体和六聚体的存在，它们的稳定性由微环境决定！
这叫做正二十面体 正二十面体天然有个五重旋转对称中心
有个六重旋转对称中心 这也是为啥足球长那个模样
正20面体是5种柏拉图立体之一 它和正十二面体是对偶： 把正二十面体每个面中点连起来 得一个正十二面体
病毒经常是正二十面体 但是因此同时也是正十二面体
很多时候人会在这些球上看到60个单元 但是数学上对称单元还是20个
#15 Re: 能教授确实很害怕alphafold 开始研究暗物质？
alphafold导致她过去引以为荣的照个别人没照过的热门分子这条路不好走了。
但是确实没砸了她的饭碗。 首先科学界有惯性 她这样的 还有更多同领域还不如她的 还不肯退休 有这么多人 就会继续有paper 有引用 有影响因子 有影响因子就可以从各自政府里拿钱 这行当的本质就这样 所以即便大家都做些脱裤子放屁的事 也是你好我好大家好 照样拿钱
其次 冰冻电镜却实可以看到计算机预测不出来的现象 有些蛋白质确实也不好预测 所以这个领域被alphafold这么一冲击 反而可能会是个好事 一部分聪明一点的人会去给更有意思的系统照相
#16 Re: 能教授确实很害怕alphafold 开始研究暗物质？
咱出国是国内导师帮咱联系的， 是个华裔教授， 但签证机票耽误了报到日期， 结果是咱的老板接待了咱， 他当时是系主任， 介绍完后， 有个最重要的选择， 就是选老板， 他就随口一说，“你不介意， 可以来我实验室”， 咱也稀里糊涂地OK了， 没想到， 这是咱一生最重要的决定！ 让同级的其他人，羡慕坏了！
“咱不杀人放火， 所以， 老天爷罩着咱！” 这是咱跟老朋友闲聊时咱说的！ “没错， 你本份， 有贵人相助， 不奇怪！”
老板 caltech 本科， 哈佛博士（导师是分子生物学之父）, Stanford 博后.
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#17 Re: 能教授确实很害怕alphafold 开始研究暗物质？
升官了。也不用在第一线做科研了huangchong 写了： 2024年 5月 9日 20:04 alphafold导致她过去引以为荣的照个别人没照过的热门分子这条路不好走了。
但是确实没砸了她的饭碗。 首先科学界有惯性 她这样的 还有更多同领域还不如她的 还不肯退休 有这么多人 就会继续有paper 有引用 有影响因子 有影响因子就可以从各自政府里拿钱 这行当的本质就这样 所以即便大家都做些脱裤子放屁的事 也是你好我好大家好 照样拿钱
其次 冰冻电镜却实可以看到计算机预测不出来的现象 有些蛋白质确实也不好预测 所以这个领域被alphafold这么一冲击 反而可能会是个好事 一部分聪明一点的人会去给更有意思的系统照相