我碰到个人，他说DNA不是双螺旋结构，只是平直拉链结构

[tops]

大凡抽提纯化过细菌质粒DNA，走过琼脂糖凝胶电泳，都不应该被这种观点带走吧。查一查DNA拓扑异构酶

[SourSweetTea]

裂害

还好啦，反正有人男的当做女的，女的当做男的
这个年代要有创造性，没啥不可以自定义的
你要说不是平的，就说你racist

[弃婴千枝]

冷冻电镜干嘛的
就是把组织冷冻了，用电镜in' situ看蛋白质2级结构

如果dna有未知的2级结构，人早给你发nature了，还等你在这里叫唤？

[verdelite]

https://www.rcsb.org/3d-view/5FKW/1

你放的三个图，搞过科研的人都知道，至少里面的DNA部分是推断的。特别是第三个，合成酶，里面DNA不可能是双螺旋的。

[verdelite]

冷冻电镜干嘛的
就是把组织冷冻了，用电镜in' situ看蛋白质2级结构

如果dna有未知的2级结构，人早给你发nature了，还等你在这里叫唤？

DNA不是蛋白质。

[tops]

DNA解旋酶不破坏共价键，只破坏氢键，相当于用力把两股绳子中间用力拉开，拉开部分变成单链，一松手双股就连回去了。

DNA拓扑异构酶会剪接共价键，产生环状DNA质粒的拓扑数变化。

[弃婴千枝]

50 年代由于无法获得高能x射线相干点光源，所以对dna or protein结构了解有很大困难

但是现在有同步辐射这个利器，可以获得极高能量的相干x射线点源，别说double helix，就是double helix内部的小结构都能看得一清二楚

嘿嘿，楼主一口咬定世人皆傻毴，被生物民科一搅和，真以为这么多人几十年的努力全是像基督教教义一样错误的

唉，可悲啊

ps，中国的同步辐射光源谁用的最多啊---就是那些杀老鼠的

[弃婴千枝]

如何获得dna protein 内部结构?药物分子内部结构？

就是用x射线衍射。。。结构越小，需要的x射线能量越高

普通钨靶最多kev能级，高了就不行了。。。。于是需要同步辐射。。。自由电子激光器，。。。。

时代不一样了

[verdelite]

50 年代由于无法获得高能x射线相干点光源，所以对dna or protein结构了解有很大困难

但是现在有同步辐射这个利器，可以获得极高能量的相干x射线点源，别说double helix，就是double helix内部的小结构都能看得一清二楚

嘿嘿，楼主一口咬定世人皆傻毴，被生物民科一搅和，真以为这么多人几十年的努力全是像基督教教义一样错误的

唉，可悲啊

ps，中国的同步辐射光源谁用的最多啊---就是那些杀老鼠的

别急着吹，你去找个“同步辐射这个利器”看“double helix内部的小结构”的照片或者文章来。

[huangchong]

你放的三个图，搞过科研的人都知道，至少里面的DNA部分是推断的。特别是第三个，合成酶，里面DNA不可能是双螺旋的。

这不是推断的。

其中的晶体结构，收的数据相当于三维结构的FT（缺了phase，但是phase可以用实验方法得到，也可以用计算方法得到，因为数据量特别大，合理的解不是碰巧就能搞到的）。

EM结构则是直接用电子显微镜拍出来的，跟你拿肉眼重构出来人脸形状这个过程基本一样，具体怎么做就不细说了。（两种做法，但是结构有多真实是毫无疑问的。现在做各种电镜直接观察到DNA，RNA，是极其常规的。）

专业和业余的分野是极其巨大的，包括上面的弃婴大师，说的话让专业的人看了都觉得搞笑。

[huangchong]

别急着吹，你去找个“同步辐射这个利器”看“double helix内部的小结构”的照片或者文章来。

https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC319307/?page=1

[verdelite]

我想了一下，要解决首楼提出的问题，除了首楼提出的方案（1，平直双链），或许还可以：
2，考察那个解旋酶，是不是分开两个链的时候，也把至少其中之一的单链分子断开，移过另一个链的阻挡，再接上。这样就从相互绕转的双链，解出两个分别自我绕转的单链。

[huangchong]

我想了一下，要解决首楼提出的问题，除了首楼提出的方案（1，平直双链），或许还可以：
2，考察那个解旋酶，是不是分开两个链的时候，也把至少其中之一的单链分子断开，移过另一个链的阻挡，再接上。这样就从相互绕转的双链，解出两个分别自我绕转的单链。

这就是拓扑异构酶干的事 细菌的质粒复制的时候就需要这种酶 不然新质粒和旧质粒会套在一起分不开 基因组也是这样 有不少DNA聚合酶就内置了拓扑异构酶活性 但是也有的聚合酶没有 我们千老折腾办个世纪 并不是光在瞎编故事的

[huangchong]

这就是拓扑异构酶干的事 细菌的质粒复制的时候就需要这种酶 不然新质粒和旧质粒会套在一起分不开 基因组也是这样 有不少DNA聚合酶就内置了拓扑异构酶活性 但是也有的聚合酶没有 我们千老折腾办个世纪 并不是光在瞎编故事的

这些东西都是上世纪就搞清的 也是因为这些研究 才有分子生物学这个学科 到了90年代末 这都是研究生一上学就需要搞懂的内容了 不然没法做实验

[omicron]

我想了一下，要解决首楼提出的问题，除了首楼提出的方案（1，平直双链），或许还可以：
2，考察那个解旋酶，是不是分开两个链的时候，也把至少其中之一的单链分子断开，移过另一个链的阻挡，再接上。这样就从相互绕转的双链，解出两个分别自我绕转的单链。

DNA复制RNA，碱基互补应该有磁铁一样的吸引力，不用旋转

我猜的，没研究过

生物的东西从工程角度思考，很容易猜为什么

这个应该是可行工程方案

[verdelite]

这就是拓扑异构酶干的事 细菌的质粒复制的时候就需要这种酶 不然新质粒和旧质粒会套在一起分不开 基因组也是这样 有不少DNA聚合酶就内置了拓扑异构酶活性 但是也有的聚合酶没有 我们千老折腾办个世纪 并不是光在瞎编故事的

我在网上看了半天拓扑异构酶那些图，就是细菌那些的，没看出来有我刚才说的那个功能。或许千老只是在研究的细菌，并没有研究高等生物对等的酶在复制和RNA制造中的作用，而因为进化路径依赖，在高等生物里面对应的酶就是在干那些事吧。

[huangchong]

这些东西都是上世纪就搞清的 也是因为这些研究 才有分子生物学这个学科 到了90年代末 这都是研究生一上学就需要搞懂的内容了 不然没法做实验

我有一本科同学曾经说过 如果没有沃森克里克的双螺旋模型 就没有现代（分子）生物学。因为这个模型是很多技术的基础 ，如果这个模型是错的，很多技术根本就不可能work。这就是所谓实践检验真理， 双螺旋这个模型 是被70年的广泛实践充分检验过的真理。（还不提我上面说的，电子显微镜早就可以直接看到DNA）

[verdelite]

DNA复制RNA，碱基互补应该有磁铁一样的吸引力，不用旋转

我猜的，没研究过

生物的东西从工程角度思考，很容易猜为什么

这个应该是可行工程方案

吸引力是肯定有的。只是仍然需要断开，越过，再接上，否则两个链在机械上还是缠绕的分不开。

[huangchong]

我在网上看了半天拓扑异构酶那些图，就是细菌那些的，没看出来有我刚才说的那个功能。或许千老只是在研究的细菌，并没有研究高等生物对等的酶在复制和RNA制造中的作用，而因为进化路径依赖，在高等生物里面对应的酶就是在干那些事吧。

这玩意怎么工作 不是普通人那眼睛看能看出来的 打开DNA链本身是个典型的酸碱催化 打开磷酸二酯键 有足够的化学知识 看那些结构才能从静态的结构了解这个过程 催化本身太快你是不可能指望能看到电影的 但是晶体学多年的研究 可以捕捉到很多中间状态 对于酶催化的每个大类 基本机理都是搞得很清楚的

[verdelite]

这玩意怎么工作 不是普通人那眼睛看能看出来的 打开DNA链本身是个典型的酸碱催化 打开磷酸二酯键 有足够的化学知识 看那些结构才能从静态的结构了解这个过程 催化本身太快你是不可能指望能看到电影的 但是晶体学多年的研究 可以捕捉到很多中间状态 对于酶催化的每个大类 基本机理都是搞得很清楚的

那我下次碰到他，把你的意见和他讲讲。