歼-9的设计方案经历了多个版本:
歼9-1、歼9-3:1965年设计,采用两侧进气与类似米格E50的常规布局后掠翼方案。
歼9-2、歼9-4:1965年设计,采用两侧进气与类似米格E150的常规布局三角翼方案。
歼9-5:1967年设计,采用类似幻影2000的大三角翼无平尾布局方案。
歼9-6-1:1970年设计,采用机腹进气与鸭式布局三角翼方案。
歼9-6-2:在歼9-6-1的基础上放大为双发动机双垂尾的重型截击机,并改为两侧进气。
歼9项目中止后,成飞仍一直独自进行该方案的研究。歼9的研究团队编入成都飞机设计研究所,并且承担了歼10的研制。歼9的研究成果、经验和教训都成为歼10的技术上的借鉴[1]
歼9-6-3:1976年设计,将歼9-6-1改为两侧进气,类似瑞典jas-39的方案。



